El IMESEX ofrece tres maestrías on validez oficial federal SEP y al concluir cada una, se obtienen también dos especialidades (tres cédulas en total).
El Instituto Mexicano de Sexología es la única organización registrada como Institución de Educación Superior que oferta posgrados con reconocimiento de validez oficial federal SEP, así como formación especializada en sexualidad en distintas áreas.
Maestrías que se ofertan:
Maestría en Sexología Educativa, Sensibilización y Manejo de Grupos
RVOE Acuerdo SEP núm. 20180045
Maestría en Discapacidad y Sexualidad
RVOE Acuerdo SEP núm. 20180046
RVOE Acuerdo SEP núm. 20180044