Programas de formación avanzada orientados al desarrollo de competencias especializadas en investigación, intervención y educación en sexualidad.
Las maestrías del IMESEX cuentan con Reconocimiento de Validez Oficial de Estudios (RVOE) otorgado por la Secretaría de Educación Pública y están orientadas a la formación especializada de profesionales en distintas áreas de la sexología.
Actualmente, el IMESEX ofrece las siguientes maestrías:
Maestría en sexología educativa, sensibilización y manejo de grupos
RVOE 2004372 con fecha del 3 de noviembre de 2000.
Maestría en discapacidad y sexualidad
RVOE 2004373 con fecha del 3 de noviembre de 2000.
Maestría en sexología clínica
RVOE 2004371 con fecha del 3 de noviembre de 2000.