El IMESEX ofrece 5 distintas especialidades en sexología y terapia de pareja, de las cuales, cuatro otorgan cédula oficial SEP.
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Especialidad en Sexología Educativa (con Reconocimiento de Validez Oficial de Estudios Acuerdo SEP núm. 20180041).
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Especialidad en Sexología Clínica (con Reconocimiento de Validez Oficial de Estudios Acuerdo SEP núm. 20180042).