El IMESEX ofrece 5 distintas especialidades en sexología y terapia de pareja, de las cuales, cuatro otorgan cédula oficial SEP.
Especialidad en Sexología Educativa (con Reconocimiento de Validez Oficial de Estudios Acuerdo SEP núm. 20180041).
Especialidad en Sexología Clínica (con Reconocimiento de Validez Oficial de Estudios Acuerdo SEP núm. 20180042).